需行体格检查，包括盆腔检查

如果受害者同意，进行检查以收集证据，并查看是否有性传播感染

妊娠试验

对于强奸的受害者，进行彻底的医学评估很重要。只要有可能，遭到强奸或性侵犯的人都会被带到性侵犯中心，该中心配备有训练有素的相关支助人员，例如性侵犯护士检查员 (SANE)。性侵害评估治疗中心可能是医院的急诊室或一个独立的机构。一些地区设有性侵犯反应小组 (SART)，其中包括医疗保健、法医、当地强奸危机中心、执法部门和检察官办公室的工作人员。

性侵犯护理团队会解释收集证据以进行最终起诉的程序（体格检查和其他检查），受害者决定是否同意。还会解释进行诉讼的利弊。受害者应在不被施压的情况下给予同意。

如果受害者选择起诉，依照法律，医疗保健专业人员需要通知警察，并对受害者进行检查。检查可以为起诉强奸犯提供证据。在强奸受害者去医院后，应尽早采集证据，采集证据前不洗澡或清洗、不刷牙、不剪指甲、不换衣服，如果可能，甚至不小便，这样采集到的证据是最佳的。有时，这些医疗检查结果能在法庭上作为呈堂证供。然而，除非受害者书面同意或发出传票，否则不能公布病历。同时这些记录也可以帮助受害者作证时回忆强奸案的细节。

强奸刚刚发生后，受害者可能会犹豫或害怕接受体检。医疗团队将尽一切可能让患者感觉舒适和安全。

在检查的每个步骤之前，医疗保健专业人员会解释接下来要做什么，并询问受害者是否允许继续检查。受害者应该可以就检查及其目的提出任何问题。受害者也可自愿拒绝检查的任何部分。

医疗保健专业人员通常会要求受害者描述事件，以帮助指导检查和治疗。然而，谈论强奸往往令受害者恐惧和苦恼。受害者可能会要求在紧急需求得到满足后再提供完整的描述。受害者可能需要即刻处理损伤，并需要一定时间来让心理平复下来。

当受害者可以接受询问时，医生会询问受害者有关强奸的问题，如：

涉及哪些身体部位（阴道、口腔和／或直肠）？

是否出现射精（精液流出）？

是否使用了避孕套？

施暴者是否进行了威胁、使用了凶器或行为残暴？

施暴者是什么样子？

为了确定受害者怀孕的可能性，医师需要询问受害者末次月经时间及是否在服用避孕药。为了帮助精子样本分析的解读，医生会询问受害者最近是否在强奸前发生过性行为，如果是，什么时候发生的。

医生会记录身体损伤，例如割伤和擦伤，并可能检查生殖器和肛门是否受伤。对伤痕拍摄照片。由于擦伤等伤痕过一会才会变得明显，因此稍后可能需要拍摄第二组照片。可行结肠镜检查，以确认是否存在细微生殖器损伤。在阴道镜检查时，使用放大镜检查阴道和子宫颈和/或肛门。

检测和证据采集刮片将用于精液或其他分泌物检测。其它样本也会被采集，例如施暴者的头发、血液或皮肤样本（有时会在受害者指甲下发现）。有时为鉴别罪犯需行DNA检查。受害者的一些衣服可能会被留下作为证据。

如果受害者同意，会进行验血和验尿以检查感染情况，包括 HIV 感染。

如果妊娠和性传播感染的初步检测结果为阴性，或者如果受害者拒绝接受性传播感染的治疗，则会在以下时间对受害者进行再次检测：

1 周时：淋病、衣原体和滴虫病

2 周时：妊娠

4 至 6 周时：梅毒和 HIV 感染

3 个月时：梅毒、肝炎和 HIV 感染

对于女性受害者，会在 6 周后进行巴氏试验以检查人乳头状瘤病毒 (HPV) 感染。

通常，在对被强奸的女性进行初次检查时，通过妊娠试验测量尿中人绒毛膜促性腺激素水平，以便检测先前是否怀孕。如果结果阴性，那么 ２ 周内需再次检测以发现强奸可能导致的怀孕。

如果受害者不能记起强奸前后发生的事件，医生可能会检查是否有证据表明强暴者使用了约会强奸药物，如苯二氮卓类的氟硝西泮或非法娱乐性药物 γ-羟基丁酸。非法药物和酒精的检测存在争议，因为醉态证据可能在诉讼中被用来破坏受害者的声誉。

如果阴道撕裂严重，尤其是儿童，可进行腹腔镜检查。在腹腔镜检查时，将一根柔性观察管插入阴道或其他器官，以便直接检查。